Одно время были такие экскурсии. Устраивались совместно с самим метрополитеном. Естественно, по туннелям никто ходить не даст
но за ночными операциями, проводимыми в метро, посмотреть было можно. Опять же - это официально было, формирование групп, заявки, представители от ГУП "СПб метрополитен", техника безопасности и прочее. Цены не кусались. Знакомый ходил - понравилось.
Как сейчас дело обстоит с этим - не в курсе. Можно поискать на Фонтанке и офф.сайте метро, и пр.